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Aggiornamenti sul virus dell'influenza

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19 Novembre 2010
Creato: 19 Novembre 2010
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Da un messaggio di uno scienziato del progetto.

Ciao,

come avrete letto sul blog di David Baker, recentemente abbiamo avuto molti interessanti sviluppi sul fronte dell’emoagglutinina influenzale, tra cui una struttura cristallina che conferma una delle progettazioni a computer e dei dati biochimici rispetto ad un’altra progettazione che dimostrano che la proteina inibisce l'azione dell’emoagglutinina. Speriamo che questo significhi che queste proteine possano servire come piattaforma per lo sviluppo di medicinali e diagnostica per molti tipi diversi di influenza. Più in generale, l’idea che la progettazione di proteine al computer potrebbe produrre proteine utili come anticorpi è un segno di maturità in questo campo. Sono molto lieto di ricordare anche che entrambe queste progettazioni, come  l'80% delle proteine che abbiamo generato nel progetto emoagglutinina, provengono dai vostri computer su Rosetta@Home. Questo progetto è stato così complesso che senza le vostre stupefacenti risorse sarebbe stato impossibile ottenere dei leganti funzionanti.

Riguardo ad un lavoro analogo, stiamo progettando più leganti putativi di RhoA, quindi vedrete più lavori di progettazione con l'etichetta "progettazione di inibitori di RhoA". Ho già introdotto RhoA in questo post.


Grazie mille! Sarel.

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The Leonids Challenge per 24 ore

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17 Novembre 2010
Creato: 17 Novembre 2010
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Unisciti a noi per il picco delle Leonidi con un challenge di 24 ore sul progetto Sophie Germain Search (LLR) project. Un Sophie Germain primo o, addirittura, una coppia di primi potrebbe essere in attesa di voi. Per maggiori informazioni, guardate questo post
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Rosetta utilizzata per la progettazione di nuovi vaccini

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16 Novembre 2010
Creato: 16 Novembre 2010
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Dal Diario del Dr. David Baker

In passato ho descritto un nuovo approccio, usando Rosetta, per la progettazione di vaccini per i quali non esistono attualmente trattamenti efficaci di vaccinazione. L’HIV, per esempio, si è rivelato essere diabolicamente efficace a eludere il sistema immunitario e, come probabilmente sapete, nonostante il molto lavoro non esiste un vaccino veramente buono. In collaborazione con altri gruppi, Rosetta è stata utilizzata per progettare piccole proteine che presentano regioni "tallone d'Achille" del virus al sistema immunitario, in modo da stimolare la produzione di anticorpi che riconoscono queste regioni. Ci sono già state le prime pubblicazioni scientifiche a riguardo e, nonostante le proteine progettate non hanno ancora suscitato reazioni fortemente neutralizzanti, vi è un notevole entusiasmo per questo nuovo approccio. Potete trovare maggiori informazioni qui (in inglese).

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Un aggiornamento sulla questione dei crediti

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17 Novembre 2010
Creato: 17 Novembre 2010
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Così so qual è il problema con i crediti extra, ma non sono sicuro del perché sia accaduto. Per qualche ragione abbiamo duplicato gli assimilatori in funzione. Stasera sarò a sistemare le cose sperando di trovare una correzione. 
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Aumento crediti su RNA

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15 Novembre 2010
Creato: 15 Novembre 2010
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È stato deciso di raddoppiare i crediti assegnati per le WU particolarmente lunghe. In particolare per quelle oltre i 2.200 crediti "normali".

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Aggiornamento dello stato - Novembre

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17 Novembre 2010
Creato: 17 Novembre 2010
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Abbiamo, recentamente, analizzato un sacco di risultati delle simulazioni sperimentali che sono state fatte negli ultimi mesi. Alcuni dei risultati sono attualmente in fase di scrittura per la pubblicazione, altri sono già stati presentati alla communità di ricerca sulla malaria nel corso dei meeting scientifici. Ecco i link dei riassunti delle presentazioni date di recente alla conferenza Parasites to Prevention: Advances in the understanding of malaria e al Annual meeting of the American Society of Tropical Medicine and Hygiene.

Modeling the effects of vector control interventions in reducing malaria transmission, morbidity and mortality

Predicted impact of mosquito-stage transmission-blocking vaccines using an ensemble of microsimulations

Using ensemble modeling to predict the cost-effectiveness of pre-erythrocytic malaria vaccines

Modeling the effects of vector control interventions in reducing malaria transmission and disease

Grazie per il vostro continuo sostegno

Nick.

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Pausa per il progetto PPS Sieve

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15 Novembre 2010
Creato: 15 Novembre 2010
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Il progetto Proth Prime Search (sieve) si prende una pausa. I risultati sino ad ora ottenuti devono essere analizzati per poi passare alla fase successiva.

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