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In questi giorni è partito un nuovo progetto WCG, ovvero "The Microbiome Immunity Project", volto a studiare il microbioma, l'insieme dei microbi che vivono e agiscono nel nostro corpo e che, talvolta, sono causa di malattie anche gravi. Qui la presentazione del progetto.

Gli amministratori di Denis hanno lanciato, in questi giorni, il sottoprogetto "Replica", il cui compito principale sarà replicare, nelle simulazioni, le ricerche e gli esperimenti già validati nella letteratura scientifica. Paragonare le simulazioni a ricerche reali aiuterà i ricercatori di Denis a migliorare ulteriormente le simulazioni del progetto. In tal senso è stata rilasciata ieri una nuova versione dell'applicativo, la "DENIS Project that replicate the calculus made in Literature and fill the Markers Database".

Qui maggiori informazioni

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Dopo molto tempo, gli amministratori di Rosetta hanno deciso di aggiornare il server del progetto all'ultima versione del software Boinc. Con l'occasione sarà rinnovata anche l'interfaccia web del sito. Il sito andrà in manutenzione per circa 24 ore nei prossimi giorni, per permettere l'aggiornamento del tutto.

Questo è un post triste: alcuni giorni fa è passata a miglior vita Anna Tramontano, pioniera della biologia computazionale in Italia e una delle fondatrici e amministratrici della competizione internazionale CASP.

Ho avuto l'occasione di scambiare un paio di mail con lei alcuni anni fa e, nonostante non necessitasse dell'infrastuttura boinc, fu molto gentile e disponibile.

Ovviamente non esiste una pagina di Wiki in italiano a lei dedicata, ma almeno è presente quella in inglese.

Anche sul sito del CASP la ricordano.

La terra ti sia lieve.

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Il buon David Anderson ha lanciato una nuova iniziativa legata al calcolo distribuito, il TBD, per il quale ha ricevuto anche fondi pubblici.

Questo il thread dove discuterne.

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Il team di Rosetta ha annunciato una nuova pubblicazione sulla rivista Science riguardante una metodologia per la previsione delle proteine attraverso la metagenomica. Con questa metodologia sono riusciti a predire in maniera accurata ben 622 famiglie di proteine non ancora rappresentate nel database internazionale PDB (Protein Database Bank) e circa 100 di queste sono assolutamente nuovi ripiegamenti mai visti. I ricercatori ringraziano tutti i volontari per il costante contributo computazionale al progetto.