ARGOMENTO:

ReLeon ha scritto:

campos ha scritto:

Come mai i file del progetto occupano (a zero WU nel PC) quasi 7 giga?

Così, per curiosità...

Dove lo vedi???

Noooooooooo, non dirmi che non lo sai….

Gattorantolo ha scritto:

ReLeon ha scritto:

campos ha scritto:

Come mai i file del progetto occupano (a zero WU nel PC) quasi 7 giga?

Così, per curiosità...

Dove lo vedi???

Noooooooooo, non dirmi che non lo sai….

Stupisciti pure, io e il pinguino non siamo mai stati tanto affiatati... non mi viene incontro come vorrei

ReLeon ha scritto:

Gattorantolo ha scritto:

ReLeon ha scritto:

campos ha scritto:

Come mai i file del progetto occupano (a zero WU nel PC) quasi 7 giga?

Così, per curiosità...

Dove lo vedi???

Noooooooooo, non dirmi che non lo sai….

Stupisciti pure, io e il pinguino non siamo mai stati tanto affiatati... non mi viene incontro come vorrei

cmq io ti ho risposto

ReLeon ha scritto:

sabayonino ha scritto:

cmq io ti ho risposto

Ci sono novità valterc????

Si, ce ne sono, cinque degli ex-studenti del corso hanno deciso di andare avanti con questa cosa con la formula del 'progetto di ricerca' (che qui da noi e` equivalente come crediti a due corsi 'normali'). Dal punto di vista scientifico si e` deciso di applicare il sistema al genoma di Escherichia coli. Ci vorra` comunque ancora un po' di tempo (a occhio direi una quindicina di giorni, ma poteri sbagliarmi sia in piu` che in meno) per ripartire a piena potenza.

valterc ha scritto:

Si, ce ne sono, cinque degli ex-studenti del corso hanno deciso di andare avanti con questa cosa con la formula del 'progetto di ricerca' (che qui da noi e` equivalente come crediti a due corsi 'normali'). Dal punto di vista scientifico si e` deciso di applicare il sistema al genoma di Escherichia coli. Ci vorra` comunque ancora un po' di tempo (a occhio direi una quindicina di giorni, ma poteri sbagliarmi sia in piu` che in meno) per ripartire a piena potenza.

...scusa il sarcasmo, ma per fortuna si tratta del "genoma", spero che la ricerca prenda in considerazione anche altri batteri quale, per esempio, l'Helicobacter pylori...

Posto pure una domanda stupida, ma perchè partire con quel batterio????
Mi interessa capirne il motivo, magari trattasi di un genoma abbastanza semplice ( parlo da profano del tema ),
o ci sono altre motivazioni??

Per quel che riguarda il progetto, ri-confermo la disponibilità a dare un valido sostegno, e aspetterò con ansia gli sviluppi del progetto.

ReLeon ha scritto:

Posto pure una domanda stupida, ma perchè partire con quel batterio????
Mi interessa capirne il motivo, magari trattasi di un genoma abbastanza semplice ( parlo da profano del tema ),
o ci sono altre motivazioni??

Se non ricordo male (son passati eoni dal liceo), trattasi di un classico organismo modello (tipo la Drosophila).
Qualcuno può confermare?

valterc ha scritto:

Si, ce ne sono, cinque degli ex-studenti del corso hanno deciso di andare avanti con questa cosa con la formula del 'progetto di ricerca' (che qui da noi e` equivalente come crediti a due corsi 'normali').

Valter, volevo farti queste due domande in privato, ma ho pensato che potessero interessare anche altri:
1) I ragazzi sono FANTASTICI, ma volevo sapere se, oltre a te, c'è anche qualche docente/ricercatore interessato a questo progetto? Lo dico perché vorrebbe dire avere le "spalle coperte" e un supporto non indifferente.
2) Avete in mente di rendere pubblico il progetto o continuiamo a macinarcelo tra di noi??

A proposito di E Coli, si, la scelta dovrebbe essere proprio legata al fatto che e` un organismo ben noto e che i dati sperimentali a ns disposizione sono 'buoni'. (ma io so poco di biologia....). Ma ci sono altri organismi in coda.

Il progetto (la parte 'espansione reti geniche') e` supportato da un professore associato di UniTN e da un ricercatore della Fondazione Edmund Mach, e piu` si va avanti, cioe` piu` comprendono le possibilita` offerte da boinc, piu` l'interesse cresce (nel senso che comprendono che possono progettare vari tipi di esperimenti). Ci sono altri gruppi di ricerca di qui che sono interessati (per esempio dei matematici che si occupano di crittografia omomorfa, argomento, se volete approfondire, molto teorico ma per me affascinante). A questo punto pero` sono io che rallento un po' per non avere troppa carne sopra il fuoco contemporaneamente.

In merito alla tempistica prevista (giusto ieri abbiamo avuto un altro meeting) penso che nuovo lavoro sara` disponiile a breve (confido entro fine mese). I tipi di seti.usa hanno, non so come, scoperto dell'esistenza del progetto e ho distribuito un paio di codici di invito anche a loro. Quando avremo nuovo lavoro provero` a 'stressare' il sistema in modo da vedere se la macchina virtuale che lo gestisce (magari un po' 'rimpolpata') ce la fa e, nel caso, l'idea e` di andare pubblici poco dopo. Se no bisogna aspettare un po' per l'hardware dedicato (e` da mesi che ho i fondi a disposizione ma non avete l'idea di quanto sia complicata la burocrazia nella pubblica amministrazione.....)

A proposito di studenti, si sono bravi, uno di loro ha anche convinto la sua vecchia scuola superiore a far girare boinc sui loro computer quando non utilizzati. Sta preparando una presentazione etc. etc. Io probabilmente ci vado (magari potresti venire anche tu, Bobo, e` dalle parti di Thiene).

valterc ha scritto:

A questo punto pero` sono io che rallento un po' per non avere troppa carne sopra il fuoco contemporaneamente.

Ottimo.
Si, si, un passo alla volta, che non c'è fretta.

Se no bisogna aspettare un po' per l'hardware dedicato (e` da mesi che ho i fondi a disposizione ma non avete l'idea di quanto sia complicata la burocrazia nella pubblica amministrazione.....)

Sta preparando una presentazione etc. etc. Io probabilmente ci vado (magari potresti venire anche tu, Bobo, e` dalle parti di Thiene).

Mmm, interessante!!

oggiscienza.wordpres...r-contrastare-le-specie-aliene-invasive/

c'è qualche connessione con il progetto trentino???

Piccolo OT : ma valterc, come si riescie a creare e a gestire una multipiattaforma????

Cioè, ci riescono in pochi.... ti servirebbe un team di supporto...

ReLeon ha scritto:

oggiscienza.wordpres...r-contrastare-le-specie-aliene-invasive/

c'è qualche connessione con il progetto trentino???

Non direttamente, il progetto e` collegato a questo gruppo di ricerca

Piccolo OT : ma valterc, come si riescie a creare e a gestire una multipiattaforma????

Cioè, ci riescono in pochi.... ti servirebbe un team di supporto...

La piattaforma ospitera` diversi progetti, dal punto di vista boinc si tratta di considerare le cosiddette 'applicazioni' come 'sottoprogetti'. Piu` o meno come fanno primegrid, wcg, yoyo e ibercivis. Non ci sono grandi difficolta`, l'unica cosa da fare (poiche` boinc non la implementa di default) e` di memorizzare separatamente i crediti generati da ogni sottoprogetto, un paio di tabelle mysql in piu` e un po` di codice qua e la. Quando si presentera` il problema (cioe` avremo piu` di un progetto), se ne avro` il tempo, provero` a proporre a David Anderson e ai vari admin una soluzione condivisa che si possa integrare nel boinc del futuro.....

Per quanto riguarda il supporto (gente), fino all'estate siamo coperti, dopo forse anche, insomma non si sa di preciso, Il lavoro di 'manutenzione' dipendera` anche da quanto saremo capaci di progettare il tutto in maniera flessibile. Magari un 'admin' in piu` per il forum non farebbe male....

valterc ha scritto:

Per quanto riguarda il supporto (gente), fino all'estate siamo coperti, dopo forse anche, insomma non si sa di preciso, Il lavoro di 'manutenzione' dipendera` anche da quanto saremo capaci di progettare il tutto in maniera flessibile. Magari un 'admin' in piu` per il forum non farebbe male....

Da anni frequento progetti, forum, ecc e mi sono fatto una mia convinzione circa il numero minimo di persone per un progetto boinc "decente":
2/3 sviluppatori/scienziati
1 sistemista server
1 admin/sviluppatore del forum

Oppure essere Simone!!!
Quello faceva tutto insieme (e bene). Un mostro

boboviz ha scritto:

Da anni frequento progetti, forum, ecc e mi sono fatto una mia convinzione circa il numero minimo di persone per un progetto boinc "decente":
2/3 sviluppatori/scienziati
1 sistemista server
1 admin/sviluppatore del forum

Oppure essere Simone!!!
Quello faceva tutto insieme (e bene). Un mostro

Però il progetto è stato attivo con lavoro solo qualche mese... Diciamo che i tuoi criteri si applicano per un progetto a lungo tempo e non facciamo scontento nessuno

valterc ha scritto:

Ci vorra` comunque ancora un po' di tempo (a occhio direi una quindicina di giorni, ma poteri sbagliarmi sia in piu` che in meno) per ripartire a piena potenza.

sono stato troppo ottimista.... comunque stiamo andando avanti. stiamo riscrivendo il work-generator in modo da ottimizzare la distribuzione dei dati di input e output, a regime avremo un unico file di input, abbastanza grosso (~70Mb, ~220Mb decompresso) che pero` rimarra` lo stesso (sticky) per mesi e mesi. Chiaramente cambiando il file di input cambia in parte anche l'applicazione.

Aggiungerei un altro paio di settimane al periodo di attesa....

Dopo le spinte intestine di Boboviz ( prima & dopo ), che ringrazio se mi risarcirà i soldi del gasolio

Faccio un piccolo discorso riguardante la giornata di ieri,
che mi ha visto ospite in un ITI vicentino in compagnia di Valterc e alcuni membri della famigerata "Squadra Speciale Cobra 11" ( il gruppo della community ) a parlare del Calcolo Distribuito,
della Community, ma sopratutto del progettone trentino.

Posso dirvi che sono arrivato all'ultimo momento utile, per il rotto della cuffia!
I ragazzi di Cobra 11 hanno spiegato agli spettatori il funzionamento, a grandi linee, del progetto, ...e anche di Boinc ( anche se solo per quello servirebbero 2 ore..) io mi sono dilungato ( 10 min ) sulla Community ( con una presentazione fresca fresca di giornata fatta dal Bobo in persona ),
Valterc ha supervisionato e risposto alle domande, con il suo savoir faire e la parlantina di chi sà.

Infine, liberatisi i posti a sedere, siamo stati a conversare con i professori che hanno permesso, assieme alla vicepreside, un evento di questo genere, dopodichè siamo andati a magnà ( un pò tardi ma in un bel posto ), chiaccherando allegramente del progetto, delle iniziative, del supporto che darà la scuola e gli allievi al calcolo distribuito, all' importanza di far sentire tali eventi, per questo ho deciso di postare questo messaggio.

Avrei preferito rimanere nell'anonimato, ma già sono stato schedato dalla polizia a Bologna al Meeting, quindi ecco il link alla news più fresca riguardo il progetto trentino.

www.itismarzotto.it/wp/progetto-gene-at-home/

Spero di essere stato Utile.

Bravo Leon!

Consiglio il pdf
La presentazione dei personaggi è da non perdere, in più si spiega l'algoritmo del progetto in modo comprensibile (più o meno) a tutti

rattorosso ha scritto:

Bravo Leon!

Consiglio il pdf
La presentazione dei personaggi è da non perdere, in più si spiega l'algoritmo del progetto in modo comprensibile (più o meno) a tutti

Molto interessante la cosa!

ReLeon

BRAVO !!!!! Bel colpo !!!!!!!!!