ARGOMENTO:

Dovrei provare una distro a 32bit per saperti dire, ma non ne ho...

I progetti sulle proteine sono quanto di più oscuro ci possa essere!
Tra Rosetta, Predictor, Proteins, Docking, Poem, Tanpaku e quelli all'interno di WCG, c'è da uscirne pazzi..

Heric ha scritto:

I progetti sulle proteine sono quanto di più oscuro ci possa essere!
Tra Rosetta, Predictor, Proteins, Docking, Poem, Tanpaku e quelli all'interno di WCG, c'è da uscirne pazzi..

ihih, come mai? Ma dici che potranno essere utili? Ho letto che la cristallografia a raggi X è più precisa, ottiene risultati migliori... anche se costa molto di più e ci vuole un po' di tempo, non è così semplice... In questo modo, hai il 60% dell'esattezza (leggevo su slides di presentazioni scientifiche, trovate su qualche sito di qualche università...). E cmq la risoluzione della struttura 3d è sufficientemente dettagliata per capire la sua funzione, ma non è precisissima... e non è molto dettagliata...

La cristallo grafia costa molto e chiaramente sarebbe meno accessibile della simulazione informatica.

209.85.129.132/searc...d=1&hl=it&ct=clnk&gl=it&client=firefox-a

Devi avere le proteine da osservare.
La simulazione tende a scoprire proteine che non hai li da osservare, ma che sai che si possono ottenere dai geni.

Per quello che ritengo sia molto importante.

Poi la Cristallo grafia ( ma anche la RM )non credo che ti dica nulla sulla interazione tra molecole, cosa che invece la simulazione puo' fare ( serve potenza di calcolo cmq ).

Aggiungo al post una mail appena arrivata dal WCG.

Help Fight Childhood Cancer

Help Fight Childhood Cancer

Project Status and Findings:
Information on the Help Fight Childhood Cancer project may be found on these pages, on the Chiba University Help Fight Childhood Cancer website (Japanese here) and on Chiba Cancer Center's Help Fight Childhood Cancer website (Japanese here). The latest status updates may also be found at this site. To discuss or ask questions about this project, please visit the Help Fight Childhood Cancer Forum.

Mission
The mission of the Help Fight Childhood Cancer project is to find drugs that can disable three particular proteins associated with neuroblastoma, one of the most frequently occurring solid tumors in children. Identifying these drugs could potentially make the disease much more curable when combined with chemotherapy treatment.

Significance
Neuroblastoma is one of the most common tumors occuring in early childhood and is the most common cause of death in children with solid cancer tumors. If this project is successful, it could dramatically increase the cure rate for neuroblastoma, providing the breakthrough for this disease that has eluded scientists thus far.

Approach
Proteins (molecules which are a bound collection of atoms) are the building blocks of all life processes. They also play an important role in the progress of diseases such as cancer.

Scientists have identified three particular proteins involved with neuroblastoma, which if disabled, could make the disease much more curable by conventional methods such as chemotherapy. This project is performing virtual chemistry experiments between these proteins and each of the three million drug candidates that scientists believe could potentially block the proteins involved. A computer program called AutoDock will test if the shape of the protein and shape of each drug candidate fit together and bond in a suitable way to disable the protein.

This work consists of 9 million virtual chemistry experiments, each of which would take hours to perform on a single computer, totaling over 8,000 years of computer time. World Community Grid is performing these computations in parallel and is thus speeding up the effort dramatically. The project is expected to be completed in two years or less.

In rilievo l'ultima parte, che la cristallografia non fa.