ARGOMENTO:

boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13533#91772



Hanno utilizzato l'applicazione di Rosetta per modellare la struttura del COVID-2-SARS
www.ipd.uw.edu/coronavirus/
new.robetta.org/results.php?id=15652

Speriamo che anche i volontari di R@H possano entrare in azione al più presto

Molto spartanamento tradotto

Grazie a tutti i volontari di R @ h per i vostri contributi per aiutarvi a modellare accuratamente importanti proteine di coronavirus. La potenza di calcolo collettiva che fornisci attraverso R @ h aiuta i gruppi di ricerca accademica in tutto il mondo a modellare importanti strutture proteiche come queste.

Da un recente post di notizie IPD:

"Siamo lieti di segnalare che la suite di modellistica molecolare Rosetta è stata recentemente utilizzata per prevedere con precisione la struttura su scala atomica di un'importante proteina coronavirus settimane prima che potesse essere misurata in laboratorio. Le conoscenze acquisite dallo studio di questa proteina virale vengono ora utilizzate per guidare la progettazione di nuovi vaccini e farmaci antivirali ".

Dal rilascio delle sequenze del genoma SARS-CoV-2 alla fine di gennaio, un certo numero di importanti proteine del virus corona come quella sopra descritta sono state modellate su computer volontari R @ h. Un elenco di queste proteine è fornito dal Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID).

Comunque ci vorrebbe una bella dose di "informazione" per il cittadino medio. C'è una quantità di allarmismo e speculazioni su amuchina e mascherine che mi viene da ridere
Per non parlare dei supermercati zona Milano praticamente svuotati (letteralmente), manco ci fosse l'apocalisse...

Oppure dall'altro lato un sacco di gente che se ne frega e fa finta di nulla...

corla99 ha scritto:

Comunque ci vorrebbe una bella dose di "informazione" per il cittadino medio. C'è una quantità di allarmismo e speculazioni su amuchina e mascherine che mi viene da ridere
Per non parlare dei supermercati zona Milano praticamente svuotati (letteralmente), manco ci fosse l'apocalisse...

Oppure dall'altro lato un sacco di gente che se ne frega e fa finta di nulla...

Più che le informazioni , bisognerebbe imparare come comunicarle
Personalmente questa isteria non la capisco, ma quando senti l'assessore alla salute di Milano, a domanda: "State valutando la chiusura dei supermercati?" rispondere: " Sì, non lo escludiamo" , è normale che l'italaino medio va in panico e assalta i negozi
Bastava rispondere: " No, per comportare la chiusura dei supermercati si deve verificare QUESTO e QUELLO. A quel punto inviteremo a fare provviste

Oppure quel genio di Conte che si dice "sorpreso" dell'aumento repentino dei contagi. Ma dai come cavolo fai a dire una cosa del genere
Gli sarà sicuramente scappatal la frase, ma l'italiano medio che cosa dovrebbe pensare


PS: che poi quelli che assaltavano i supermercati compravano tutti la farina: ma che ca**o devi farci comprati 20kg di pasta e buonanotte

Padova studia algoritmo per trovare nuovi casi
"Stiamo studiando il modello matematico dell'infezione per cercare di capire chi è il potenziale contagiato positivo prima che venga alla luce. Questo ci consentirebbe di essere un passo avanti e di capire chi sottoporre al test attraverso l'analisi dei contatti". Lo ha detto oggi Stefano Merigliano, presidente della scuola di Medicina dell'Università di Padova, a proposito dell'emergenza coronavirus.

qui ci vuole un nuovo progetto matematico per Boinc

Su WCG forum c'è questo thread , ma mi sembra più una raccolta di News che altro.

Poi :
www.worldcommunitygr.../viewthread_thread,42131_offset,0#620812

Folding@Home ha iniziato a distribuire le nuove wu per studiare il coronavirus

Qui il post su Twitter

Ci sono su FAH.
Anche se non vedo ancora una applicazione/progetto dedicato dal menu a tendina (arriverà ? )

sabayonino ha scritto:

Anche se non vedo ancora una applicazione/progetto dedicato dal menu a tendina (arriverà ? )

Lo stanno chiedendo in tanti sull'account Twitter di F@H

foldingforum.org/vie...ic.php?f=17&t=32124&hilit=corona#p311359

Credo stiano preparando l'applicazione

4 pure qui a Verona. Daje.

Lo studio (italiano) che ha ricostruito il salto di specie del Corona Virus

I particolari, qui

Esaurita la coda di WU, ho dedicato la gpu a folding@home. :ruota:

Il "primo" untore

Dopo una settimana di pausa, per prendere un po' di respiro dopo i recenti ch ed il TdP, volevo girare i pc su Rosetta o Folding.

Da quanto ho capito F@H sta ancora preparando l'applicazione, mentre su Rosetta non c'è modo di elaborare esclusivamente wu riguardanti il coronavirus, giusto?
Considerando che tornerò a regime per lunedì, su quale mi consigliate di "puntare"?

Dall'inizio dell'emergenza gli utenti su Rosetta sono aumentati

corla99 ha scritto:

Dopo una settimana di pausa, per prendere un po' di respiro dopo i recenti ch ed il TdP, volevo girare i pc su Rosetta o Folding.

Da quanto ho capito F@H sta ancora preparando l'applicazione, mentre su Rosetta non c'è modo di elaborare esclusivamente wu riguardanti il coronavirus, giusto?
Considerando che tornerò a regime per lunedì, su quale mi consigliate di "puntare"?

Ti ricordo che da martedì 10/3 inizia la fase bunker per il nostro challlenge TN-Grid
A sto punto puoi dedicare qualche core a Rosetta, magari tenendo breve la durata delle wu
Oppure fai ancora qualche giorno di power saving, visto che il challenge ci occuperà per 13gg

Tornando in topic, è qustione di ore, l'istituzione della zona rossa o arancione, nei comuni di Alzano Lombardo e Nembro. Praticamente a 3km da me

Il bunker posso farlo solo sul 1800X e forse col 3900X. Ma non riesco a farlo sul doppio xeon.
Quindi volevo dedicarlo ad altro in attesa di arrivare alla finestra utile di bunker.

Anche perché ho da finire la nuova scrivania e rivedere tutta la gestione cavi/ups/rete con conseguente stop dei pc.

Siccome Rosetta è l'opzione più gestibile al momento, da lunedì andrò su quella per poi virare su TN-Grid

PS. non riesco a trovare una notizia su un giornale online che non necessiti di abbonamento per essere letta...
ma a quanto sembra ci sono due "varianti" del virus: una letale e l'altra no.
Una provoca febbre, tosse e gli altri classici sintomi da influenza
L'altra è quella che ti porta a sviluppare gravi problemi respiratori (polmoniti, ecc) che nella maggior parte dei casi sono classificati come "in condizioni gravi"
Finché non sarà ripresa anche da altre fonti, non la prenderei per verità assoluta...

Liberamente leggibile c'è questo:
Coronavirus, Rezza (Iss): “Cause dei decessi? Aspettare esiti delle autopsie per stabilire”

In particolare:

Il 74,6% delle persone che hanno perso la vita nelle ultime settimane e che sono state trovate positive ai tamponi soffriva di ipertensione, seguita dalla cardiopatia ischemica (presente nel 70,4% dei casi) e dal diabete mellito (presente nel 33,8% dei pazienti).

corla99 ha scritto:

Il bunker posso farlo solo sul 1800X e forse col 3900X. Ma non riesco a farlo sul doppio xeon.
Quindi volevo dedicarlo ad altro in attesa di arrivare alla finestra utile di bunker.[/quote

Facendo due conti con i dati di WUProp, per sfruttare al massimo il 1800x e il 3900x, dovresti ricorrere ai client multipliù
Entrambi dovrebbero impiegare 3,1h, quindi:
1800x: 24/3,1*16= 123wu x 6gg= 743wu
3900x: 24/3,1*24= 185wu x6gg= 1114 wu

corla99 ha scritto:

Anche perché ho da finire la nuova scrivania e rivedere tutta la gestione cavi/ups/rete con conseguente stop dei pc.[/quote

Mi raccomando, fai delle foto ad opera terminata

@Corla & @Buro

State andando OT.
C'è la discussione per il challenge