ARGOMENTO:

Herr Fritz 27 ha scritto:

Il capo progetto di Rosetta@Home, David Baker, aggiorna il suo diario con le ultime notizie riguardanti il suo progetto, in particolare sull'elezione di Rosetta@Home come primo progetto del BOINC Pentathlon e circa l'ultima novità introdotta messa subito alla prova durante la sfida CAMEO.

Ma questo "Cameo" (ma nomi migliori no?) è un'altra sfida?
Parallela al Casp??

Che io sappia è una sfida ma non parallela al CASP. Secondo me è qualcosa che fanno "in preparazione" al CASP.

Gattorantolo ha scritto:

Grazie Herr Fritz, riproverò tra un po a riattacarmi al progetto...vedremo dai...

Ora sembrerebbe funzionare tutto...miracolosamente

Gattorantolo ha scritto:

Ora sembrerebbe funzionare tutto...miracolosamente

Gattorantolo ha scritto:

Gattorantolo ha scritto:

Grazie Herr Fritz, riproverò tra un po a riattacarmi al progetto...vedremo dai...

Ora sembrerebbe funzionare tutto...miracolosamente

col passaggio a mini rosetta 3.30?

e ora con rosetta!

Flaming ha scritto:

Gattorantolo ha scritto:

Gattorantolo ha scritto:

Grazie Herr Fritz, riproverò tra un po a riattacarmi al progetto...vedremo dai...

Ora sembrerebbe funzionare tutto...miracolosamente

col passaggio a mini rosetta 3.30?

e ora con rosetta!

Si, mini Rosetta 3.30!

E' stato aperto il thread ufficiale per il CASP 10, con alcune indicazioni operative:

CASP 10, a community wide experiment in structure prediction starts tomorrow on May 1st and runs to August 1st.

3 mesi di fuoco

Sequences, whose structures have been solved but which have not yet been published are sent out to participating teams and we have a 3 days to send back predictions

Ci devono mettere 3 giorni per restituire i risultati....

If your work unit starts with the label rb you're running a CASP 10 target! rb is short for Robetta which is our publicly available server for structure prediction.

Le wu che iniziano per rb_ sono quelle del Casp

Consigliano, per chi vuole, di abbassare il buffer di wu ad un paio di giorni

boboviz ha scritto:

Le wu che iniziano per rb_ sono quelle del Casp
Consigliano, per chi vuole, di abbassare il buffer di wu ad un paio di giorni

E... quindi che significa 'sta cosa?
Io ho 295 WU di Rosetta, 120 già sospese e 294 iniziano per "rb_"

Rick! ha scritto:

E... quindi che significa 'sta cosa?
Io ho 295 WU di Rosetta, 120 già sospese e 294 iniziano per "rb_"

Ha risposto David in persona:

Yes you are absolutely right. for CASP we need results back within a day or two, as our approach is iterative: we analyze the results after one day and send out another set of wu based on these results for two days of computing, then collect the results and submit to CASP. so please do set your buffer to a shorter time, and let us know if you are running out of wu. thanks!

boboviz ha scritto:

Rick! ha scritto:

E... quindi che significa 'sta cosa?
Io ho 295 WU di Rosetta, 120 già sospese e 294 iniziano per "rb_"

Ha risposto David in persona:

Yes you are absolutely right. for CASP we need results back within a day or two, as our approach is iterative: we analyze the results after one day and send out another set of wu based on these results for two days of computing, then collect the results and submit to CASP. so please do set your buffer to a shorter time, and let us know if you are running out of wu. thanks!

Quindi che faccio? Gliele riverso e tanti saluti al Pentathlon?

Rick! ha scritto:

Quindi che faccio? Gliele riverso e tanti saluti al Pentathlon?

E' la stessa identica cosa che ho pensato io
A loro sembra interessare tanta potenza nel breve periodo (1-2 giorni), così da analizzare subito i risultati e mandare nuovi batch per "affinare" la ricerca.
Ovviamente non obbligano nessuno ad abbassare tali parametri.

boboviz ha scritto:

Rick! ha scritto:

Quindi che faccio? Gliele riverso e tanti saluti al Pentathlon?

E' la stessa identica cosa che ho pensato io
A loro sembra interessare tanta potenza nel breve periodo (1-2 giorni), così da analizzare subito i risultati e mandare nuovi batch per "affinare" la ricerca.
Ovviamente non obbligano nessuno ad abbassare tali parametri.

Bon, allora lascio le cose come stanno.
Lo strumento per fare i loro, sacrosanti, interessi ce l'hanno ed è la deadline; quindi visto che TUTTE le WU che ho scadono il 9... la scelta è facile per me, anche perché il CASP se ho ben capito si sviluppa su molti mesi, quindi tempo ce n'è a sufficienza per tutto.

Poi resto cmq disponibile a cambiare idea se il team pensa che sbaglio a non riportare.

Bye, R!

Rick! ha scritto:

Lo strumento per fare i loro, sacrosanti, interessi ce l'hanno ed è la deadline; quindi visto che TUTTE le WU che ho scadono il 9... la scelta è facile per me, anche perché il CASP se ho ben capito si sviluppa su molti mesi, quindi tempo ce n'è a sufficienza per tutto.

Ma infatti è stato pure suggerito loro sul forum, di separare i task urgenti da quelli "standard":

In order to distinguish between urgent and non-urgent tasks, CASP10 tasks should have (say) 2-day deadlines & all others the usual 10-day deadline.

Altri passaggi interessanti dal forum sul casp

Preliminary results indicate that we've made more improvement in the last two years than in the previous 6 years combined. .

Gli ultimi 2 anni sono stati migliori degli altri 6 precedenti....

For the first time there is significant doubt wether humans can improve upon the results from computers. So this could be a very exciting CASP

Gli uomini non sanno migliorare più i risultati prodotti dai pc???

boboviz ha scritto:

For the first time there is significant doubt wether humans can improve upon the results from computers. So this could be a very exciting CASP

Interessante... Ma che c'entrano i castrati???

Scherzi a parte, davvero curioso...

Che significa???
06.05.2012 19:51:26 | rosetta@home | Reporting 5 completed tasks, requesting new tasks for CPU and NVIDIA GPU
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | Scheduler request completed: got 0 new tasks
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | No work sent
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | (reached daily quota of 8 results)

...un limite giornaliero di 8 risultati? Che è???? Tra un po non avrò piu WU e la cosa inizia a rompermi in quanto sul numero 3...

Gattorantolo ha scritto:

Che significa???
06.05.2012 19:51:26 | rosetta@home | Reporting 5 completed tasks, requesting new tasks for CPU and NVIDIA GPU
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | Scheduler request completed: got 0 new tasks
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | No work sent
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | (reached daily quota of 8 results)

...un limite giornaliero di 8 risultati? Che è???? Tra un po non avrò piu WU e la cosa inizia a rompermi in quanto sul numero 3...

Troppe WU in errore? googloando al volo ho trovato questo su rosetta e questo su GPUGRID .
E' un comportamento normale di BOINC a quanto pare.

Rick! ha scritto:

Gattorantolo ha scritto:

Che significa???
06.05.2012 19:51:26 | rosetta@home | Reporting 5 completed tasks, requesting new tasks for CPU and NVIDIA GPU
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | Scheduler request completed: got 0 new tasks
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | No work sent
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | (reached daily quota of 8 results)

...un limite giornaliero di 8 risultati? Che è???? Tra un po non avrò piu WU e la cosa inizia a rompermi in quanto sul numero 3...

Troppe WU in errore? googloando al volo ho trovato questo su rosetta e questo su GPUGRID .
E' un comportamento normale di BOINC a quanto pare.

Su oltre 150 WU consegnate a partire da ieri "solo" 5 o 6 sono andate in errore quindi il problema non è li...che faccio? Non ho ormai più WU ora...

Gattorantolo ha scritto:

Rick! ha scritto:

Gattorantolo ha scritto:

Che significa???
06.05.2012 19:51:26 | rosetta@home | Reporting 5 completed tasks, requesting new tasks for CPU and NVIDIA GPU
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | Scheduler request completed: got 0 new tasks
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | No work sent
06.05.2012 19:51:28 | rosetta@home | (reached daily quota of 8 results)

...un limite giornaliero di 8 risultati? Che è???? Tra un po non avrò piu WU e la cosa inizia a rompermi in quanto sul numero 3...

Troppe WU in errore? googloando al volo ho trovato questo su rosetta e questo su GPUGRID .
E' un comportamento normale di BOINC a quanto pare.

Su oltre 150 WU consegnate a partire da ieri "solo" 5 o 6 sono andate in errore quindi il problema non è li...che faccio? Non ho ormai più WU ora...

Niente da fare, da ieri sera oramai non posso piu cotribuire col mio PC numero 3 al Pentathlon per Rosetta, mi esce sempre il solito misterioso messaggio che mi dice che ho raggiunto 8 risultati giornalieri vabe, che ci posso fare? Al momento ho ripiegato su Docking e Malaria che di questi problemi non ne hanno!

Gattorantolo ha scritto:

Niente da fare, da ieri sera oramai non posso piu cotribuire col mio PC numero 3 al Pentathlon per Rosetta, mi esce sempre il solito misterioso messaggio che mi dice che ho raggiunto 8 risultati giornalieri vabe, che ci posso fare? Al momento ho ripiegato su Docking e Malaria che di questi problemi non ne hanno!

Passa a WCG, YoYo e QMC che sono il quarto e quinto progetto per il Pentathlon e mettilo al