ARGOMENTO:

E' uscita anche la versione 3.57 e vanno tutte in errore di validazione

Dopo la breve vita della versione 3.57 (avran buttato fuori, in tutto, un centinaio di wus), adesso arriva la versione 3.58.
Speriamo sia testata meglio delle precedenti e che entri a regime su Rosetta.

boboviz ha scritto:

Dopo la breve vita della versione 3.57 (avran buttato fuori, in tutto, un centinaio di wus), adesso arriva la versione 3.58.
Speriamo sia testata meglio delle precedenti e che entri a regime su Rosetta.

Sono già finite...

a me sono arrivate delle "beta 3.58" ma anche delle 3.54
è normale ?

astroale ha scritto:

a me sono arrivate delle "beta 3.58" ma anche delle 3.54
è normale ?

Confermo: anche a me sono arrivate delle 3.54...

campos ha scritto:

astroale ha scritto:

a me sono arrivate delle "beta 3.58" ma anche delle 3.54
è normale ?

Confermo: anche a me sono arrivate delle 3.54...

anche a me oggi sono arrivate ...

Stamattina due bei batch di sole 3.54.
Tutte in errore dopo pochi secondi

E' partito un batch particolare.
Le macchine windows e linux a 64 bit scaricano la versione corrente, la 3.59
Chi ha pc con sistemi a 32 bit scarica la nuova 3.60.
Che sia l'inizio delle ottimizzazioni su cui stanno lavorando???

Nuova versione dell'applicativo (la 3.61) con vari miglioramenti dei protocolli.
Hanno inoltre implementato le SSE sulle wu windows e non su quelle linux (a causa delle molte wu in errore).
Ho chiesto che versione delle SSE....

E subito esce la 3.62

For the 3.62 update, I reverted the windows application back to the 32bit non-sse build, and also reverted the linux application to the 32bit build (for the 64bit apps). There was a significant fraction of errors which prompted the change. We will do another update soon related to the "Option matching -relax:cyclic_peptide not found in command line top-level context" errors.

Son tornati al codice pre-ottimizzazione per capire gli errori

Dopo molte settimane, ecco una nuova versione, la 3.63
Nuovo applicativo, nuovo screensaver, nuovo database.
Chissà se ci sono le ottimizzazioni

Io lo vedo uguale lo screensaver

non che me ne importi poi molto, l'ho aperto solo perchè hai detto che l'hanno cambiato
Speriamo più nelle ottimizzazioni

Talon ha scritto:

Io lo vedo uguale lo screensaver
non che me ne importi poi molto, l'ho aperto solo perchè hai detto che l'hanno cambiato

Lo hanno fatto, molto probabilmente, per renderlo compatibile con il nuovo applicativo.

Speriamo più nelle ottimizzazioni

Con W10 non ho problemi, con Ubuntu mi crashano tutte dopo zero secondi...

campos ha scritto:

Con W10 non ho problemi, con Ubuntu mi crashano tutte dopo zero secondi...

Infatti hanno buttato fuori due nuove versioni. La 3.64 per windows e una ulteriore 3.65 per linux, per risolvere il problema.
Per quanto riguarda le ottimizzazioni, le notizie sono quelle anticipate da Xdarma:

I've been too busy to look into optimizations. We do have one volunteer helping us out however. I'll keep you all posted if anything develops.

C'ha troppo da fare e ha delegato tutto al volontario.
Ma scusate, nel BakerLab ci son decine di persone e a sviluppare il codice è uno solo??

Uh, un batch consistente della vecchia versione, la 3.64.
Chissà perchè

Hanno buttato fuori una nuova versione per tutti gli OS, la 3.68
Peccato che abbiano ripreso con la vecchia abitudine di lanciarli nottetempo (qui da noi).
Beccarne qualcuna è sempre una impresa

Almeno ci sono novità sul fronte codice, da parte dell'amico di Xdarma:

Some news. I was granted a source license and I have started wading in. The documentation is dated and inaccurate (as always). I am looking to hook up with a developer to focus on the configuration they build for this project and feed back findings.

Maybe something will surface.

Quindi, hanno i server del 2007, codice vecchio e non ottimizzato e documentazione datata e inaccurata
Niente da dire

Il buon rjs5 ha condiviso su Ralph alcune considerazioni riguardanti l'ottimizzazione del codice rosetta e non sono per niente incoraggianti:

I have a couple unanswered messages to developers volunteering time and expertise. If anyone has interested contacts, please pass me along to them.

Ha scritto agli admin per alcuni suggerimenti e nessuno gli ha risposto. Andiamo bene

Rosetta is compiled and statically linked with ALL the performance modification made to it over the years. It is hard to detect when yesterdays big performance boost becomes today's performance bottleneck

Rosetta è compilato e linkato staticamente e quindi è difficile capire cosa potrebbe ottimizzare l'esecuzione e cosa, invece, potrebbe trasformarsi in un collo di bottiglia.

It would be FAR easier for them to simply inflate credits somewhat to attract and retain more crunchers than to invest in Rosetta performance improvements

A questo punto son quasi d'accordo con rjs5. Meglio aumentare i punteggi per attirare più gente che fare ottimizzazioni senza esserne convinti fino in fondo (e sembra l'atteggiamento degli admin)

In genere, in questi casi qui, quando il software ha avuto diverse stratificazioni dovute a molte mani che ci hanno messo del loro, è mooolto melgio buttare tutto a mare e ripartire totalmente da zero !!!!
Anche se sembra la soluzione più lunga.
Oppure lasciare tutto com'è e buona notte ai suonatori !!!!