ARGOMENTO:

Dai un Update a tutti e via

Già fatto da qualche giorno, lo faccio in continuazione ma niente!

Come per magia stamattina tutto ok... Mah...

Bene così, ci vuole sempre un pò a aggiustare il tutto

Stanno lavorando anche sulle GPU

Yes, the group is working in porting MD to GPU but it will take some time before we get to a point of doing docking on GPU. It's in our plans but for a long term period of time.

Speriamo che partano con qualche beta da provare....

negli ultimi giorni ci sono poche wu, anzi, nessuna praticamente...guardando lo stato dei server, ogni tanto compaiono una 40ina di wu, ma che ovviamente vengono subito scaccolate...ci sono problemi?

robertogl [HWU] ha scritto:

negli ultimi giorni ci sono poche wu, anzi, nessuna praticamente...guardando lo stato dei server, ogni tanto compaiono una 40ina di wu, ma che ovviamente vengono subito scaccolate...ci sono problemi?

ni

mi era sfuggito questo post sul loro forum che vi giro:

Hi All,

Thank you Conan for your help answering this thread, indeed we wanted to keep a low volume of workunits distributed for the relocation. The new server is now physically here, but we are still in the process of moving the parts that need to be moved. From now until we have the new server completely in place we will keep a low distribution (due to the current issues with the space). But after that (in about 1 or 2 weeks) our distribution will be back to normal and we will start testing a new model (model 14: more complex, longer and accurate than the model 13 that we are testing currently)

Thank you all for your patience with the project.

Regards

Spostamento server in arrivo: tengono bassa la distribuzione di WU fino a completamento dell'operazione (credo entro la fine della prox settimana)


P.S. altra cosa vista sul loro forum: alcuni utenti con WINDOWS 7 (sia 32 che 64 bit) lamentano che le WU si piantano e non vanno avanti. Il problema è ancora irrisolto.

grazie
Coumunque a me su win 7 64bit tutto perfetto

2010-02-02
Tomorrow D@H will start crossdocking, it is a critical change but we expect we will move smoothly. Please be patient in the event of possible crashes

qualunque cosa voglia dire..

Ducati 749 ha scritto:

2010-02-02
Tomorrow D@H will start crossdocking, it is a critical change but we expect we will move smoothly. Please be patient in the event of possible crashes

qualunque cosa voglia dire..

boh...ma le wu sono aumentate notevolmente...non so se centra qualcosa

Ducati 749 ha scritto:

2010-02-02
Tomorrow D@H will start crossdocking, it is a critical change but we expect we will move smoothly. Please be patient in the event of possible crashes

qualunque cosa voglia dire..

Ho trovato qualche informazione: LINK

Quel che ho capito è che nel docking "semplice" prendono la struttura cristallizzata della proteina, tolgono un ligando (immagino quindi già legato), ne randomizzano la conformazione (ecco, questo davvero non capisco cosa voglia dire.. una molecola quante conformazioni avrà mai?) e poi li fanno combinare assieme.

Nel "crossdocking" invece si fa la stessa cosa ma utilizzando una versione diversa della proteina

Sinceramente credo ci serva un biochimico o un biologo per spiegare sta cosa, a me non è molto chiaro...

E' da quando ho finito le simap che boinc elabora praticamente solo docking: ogni tanto si vede qualche malaria e qualche wcg, ma ad esempio di rosetta non se ne vedono... Come mai docking ha monopolizzato la cpu se non è cambiato niente tra prima e dopo?

akd ha scritto:

E' da quando ho finito le simap che boinc elabora praticamente solo docking: ogni tanto si vede qualche malaria e qualche wcg, ma ad esempio di rosetta non se ne vedono... Come mai docking ha monopolizzato la cpu se non è cambiato niente tra prima e dopo?

A me docking ha sempre riempito bene la cache e solo Malaria riusciva a inserirsi, scaricando un sacco di WU e mandandole in elaborazione ad alta priorità.
Forse sottostimano i tempi di elaborazione e mandano più WU del necessario, ma non uno sproposito, e così il BOINC manager non chiede WU di altri progetti.

Sarà una mia impressione ma gli ultimi manager gestiscono malissimo la cache di WU se si è connessi a più progetti

baxnimis ha scritto:

Sarà una mia impressione ma gli ultimi manager gestiscono malissimo la cache di WU se si è connessi a più progetti

Confermo la tua impressione. Io ho 2 cpu lente e 1 gpu che mi fa oltre il 90% del rac, in più supporto più di 30 progetti.
Per dirvi solo l'ultima: dopo il challenge di prime, per cui avevo bloccato tutti i progetti tranne Prime e Gpugrid, ad oggi che ho ripristinato tutto a come era prima, il Manager continua a richiedere wu di Prime per Cpu ignorando tutti gli altri progetti che sono sotto rispetto alle risorse assegnate...

Confermo la pessima gestione della cache degli ultimi boinc... Solo che le condizioni, i settaggi e tutto quanto è uguale a prima di simap, ma adesso sta continuando a elaborare docking, in barba al resource share soprattutto...

akd ha scritto:

in barba al resource share soprattutto...

Arghhhh, il resource share....

anche a voi sono arrivate wu strane? nel senso, prima con cpu time 12ca mi dava 135 crediti, ora cpu time 2 e mi da 102 crediti!!

robertogl [HWU] ha scritto:

anche a voi sono arrivate wu strane? nel senso, prima con cpu time 12ca mi dava 135 crediti, ora cpu time 2 e mi da 102 crediti!!

quelle da 135 crediti sono le nuove, le crossdocking, e non pagano molto in confronto al tempo CPU

invece stranamente le WU "standard" hanno mediamente ridotto il tempo di elaborazione a parità di crediti (102)

direi che è un paio di giorni che mediamente si fa il 50%-70% di WU e crediti in più

come mai io ho sempre ricevuto solo le nuove wu?
con queste, che quindi sarebbero quelle vecchie, faccio crediti a valanghe
ma se sono standard fin'ora dove stavano?

Link

Sembra che ci siano problemi con alcune configurazioni in particolare con Intel + Windows 7 64bit