ARGOMENTO:

Non ho idea se questo 3950x ksia a frequenza stock o in oc.
Resta il fatto che sta raggiungendo un RAC di 38k su Tn-grid

Probabilmente è stock. Il 3900X con boost disattivato (massimo 3.8GHz) mi faceva poco più di 30K

Mi hanno chiesto se TN-grid ha a che fare con SARS-COV-2, incollo anche qui la mia risposta

Ciao, anche oggi abbiamo aggiunto un po' di cose collegate a SARS-COV-2 (il 'coronavirus'). In questo momento, finché non avremmo più notizie dai biologi/immunologi (stiamo per far partire un progetto comune) solo una parte del lavoro e` mirato al virus (i geni che un po' si sa possano essere collegati al problema). Il resto del lavoro che facciamo sono tutti i geni del nostro genoma, alcuni ci avranno a che fare, altri no, per ora non lo sappiamo. Cioè non sappiamo, per esempio quanto essere ipertesi, aggravi o meno i danni della malattia. La cosa e` nuova, un po' si spara a caso nel mucchio (tipo provare i farmaci contro la malaria) anche confidando in un po' di fortuna.

Quindi alla tua domanda puntuale non so rispondere, al momento se ci partecipate un po' saremmo contenti. Se parte il progetto di cui sopra probabilmente chiederemo un aiuto più importante.

Grazie Valter.

In aggiunta , riporto da quanto te indicato nel forum del progetto

Added a few genes, related to DPP4, according to StringDB:
INS GIP SLC5A2 SLC5A5 ADA GCG GLP1R

ve la butto li cosi`, fra un po', se tutto va bene, si potranno fare conti per TN-Grid anche su aggeggi 'strani', tipo Linksys WRT3200ACM (esatto, un router.....), come questo

Valter ha ha caricato tutti igeni del Sars-Cov2. ecco il post

I geni sono dalla 165735_Hs al 166977_Hs
1242 geni, composti da 294wu ciascuno, per due copie, fa: 1242 *294 *2= 730.296 wu

Altre interessanti informazioni fornite da Valter
ecco il testo originale

We already published the OneGenE (expansion of all the genes) results for a Vitis vinifera dataset (Vespucci).

The OneGeneE project for Homo sapiens FANTOM-5 gene expression dataset is our 'background' job, and it is a very long one. We normally put genes in the queue in alphabetic order (actually it is by 'number of isoforms', but it would be the same). At the very beginning we started by prioritizing genes related to neurovegetative diseases, then to some types of cancer, right now any gene possibly related to COVID-19 (you guess why...).

Any result we got is immediately available to the scientific community (biologists etc.), for example the ACE2 expansions we completed a few days ago will soon be analyzed by a immunologist, etc.

We are also studying the possibility of doing some work on specific gene datasets recently made up from cells of SARS-CoV-2 infected individuals. In this case we will put 'on hold' the OneGenE Hs project.

Riassumendo, il progetto OneGene sull'espansione genetica del dataset Homo Sapiens FANTOM-5 è il loro progetto in "background", ed andrà per le lunghe.
Oltre a ciò, fanno esperimenti più veloci. Ad esempio geni riguardanti malattie neurovegetative, poi vari tipi di cancro; e attualmente geni relativi al COVID-19

Stanno anche studiando la possibilità di lavorare su specifici datasets di geni provenienti da cellule di individui risultati positivi al Sars-Cov2.
In questo caso, questo esperimento avrà la priorità

gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=265

ci stiamo dando sotto, con 25000Ghz abbiamo messo su tn grid penso piu di 1500 threads ....

ciao volevo dar una mano anche a questo progetto ma serve un codice d'invito
come posso fare?

E' indicato nella home page del progetto.

Ok grazie

Fabrizio74 ha scritto:

Ok grazie

Come detto da saba è nella home del progetto.
comunque basta che, quando aggiungi un progetto inserisci

URL: gene.disi.unitn.it/test/
codice invito: science@tn

Per chi fosse interessato, ora c'è anche l'applicativo per Mac. 1.10 (sse2) sviluppata in 2gg dal volontario Dotsch
ecco il post

Vedi cosa vuol avere Valterc come amministratore di un progetto...

ReLeon ha scritto:

Vedi cosa vuol avere Valterc come amministratore di un progetto... [/quote

Concordo. Questa forte interazione con l'admin del progetto, è molto apprezzata dagli
E ciò e manifestato dal fatto che dopo la fine del challenge del mese scorso, molti utenti sono rimasti sul progetto.
E da quando il 1 aprile ha annunciato di essere al lavoro sul Sars-Cov-2, la potenza è aumentata ulteriormente; attualmente è a 20.4 TFLOPS
Durante il challenge era arrivata a 19 TFLOPS

Buro87 ha scritto:

.
E da quando il 1 aprile ha annunciato di essere al lavoro sul Sars-Cov-2, la potenza è aumentata ulteriormente; attualmente è a 20.4 TFLOPS
Durante il challenge era arrivata a 19 TFLOPS

probabilmente anche perchè si è aggiunto ip18, già primo per rac e che probabilmente doppierà (sempre a proposito del rac) il secondo best user

robix73 ha scritto:

Buro87 ha scritto:

.
E da quando il 1 aprile ha annunciato di essere al lavoro sul Sars-Cov-2, la potenza è aumentata ulteriormente; attualmente è a 20.4 TFLOPS
Durante il challenge era arrivata a 19 TFLOPS

probabilmente anche perchè si è aggiunto ip18, già primo per rac e che probabilmente doppierà (sempre a proposito del rac) il secondo best user

Eh si vede
Avete svuotato la coda gene.disi.unitn.it/test/server_status.php

La cosa positiva di questa situazione è che ha quantificato quali fossero i limiti del server (fino ad ora solo teorici)
Tale situazione è iniziata ieri sera, perciò è ancora presto per tirare conclusioni precise.
Quello che ho notato è:

-ritmo creazione wu (detto da Valter): 294wu (588 con i replicanti) generate ogni 15min = 56448 wu/giorno
- ritmo di 47000wu che riesce a gestire stabilmente (durante lo scorso challenge era arrivato a picchidi 53000wu)
-potenza copmputazionale massima: 21000GFLOPS

Comunque, come detto da Valter, nel thread sul Sars-Cov-2, questo studio l'hanno fatto in risposta ad una richiesta del governo, e tra le altre cose, hanno chiesto fondi per un altro server. Speriamo

Buro87 ha scritto:

Comunque, come detto da Valter, nel thread sul Sars-Cov-2, questo studio l'hanno fatto in risposta ad una richiesta del governo, e tra le altre cose, hanno chiesto fondi per un altro server. Speriamo

Speriamo vengano approvati i fondi perché passata l'emergenza covid quei server resteranno e si ripagheranno ampiamente.

Delle circa 46000 wu in corso 11000 circa le abbiamo noi

Ma quanto potrà costare un server? Si può pensare a una colletta su un sito di Crowdfunding, da sponsorizzare su tutta la comunità Boinc internazionale. Sarebbero proprio soldi usati bene.