ARGOMENTO:

mi pare di aver capito che da qualche parte c'è la spiegazione ma non riesco a trovarla...

Venturini Dario ha scritto:

Pare pochino anche a me... che CPU è?

Intel(R) Core(TM) Duo CPU T2350 @ 1.86GHz

Ho un RAC di 16.19 e ci sto elaborando da 3gg circa...

valeriot84 ha scritto:

ciao...
sto elaborando rosetta in questo momento...
quando apro "mostra grafici" mi appare l'immagine qui sotto!
qualcuno sa fornirmi maggiori dettagli sul significato?
grazie
ciao ciao

Guarda nella prima pagina del thread e trovi tutto

Balint ha scritto:

Venturini Dario ha scritto:

Pare pochino anche a me... che CPU è?

Intel(R) Core(TM) Duo CPU T2350 @ 1.86GHz

Ho un RAC di 16.19 e ci sto elaborando da 3gg circa...

Il RAC si stabilizza dopo 15 giorni circa e varia a seconda delle ore di elaborazione. Sei sicuro che di media tu faccia 15 crediti per WU? Non è che ti sei confuso con il RAC?

Il "granted credit" che si può leggere in Tasks dal sito di Rosetta varia da 12 a 17, la media di 15 l'ho fatta così a naso

C'è da dire che i Core2Duo serie T2xxx sono un pò debolucci, però 15 crediti son proprio pochi... Io con un Athlon64 a 2500Mhz ne faccio 50 in 4 ore

l'ho fatto; c'è il link dello screen saver con la spiegazione ma ci clicco e mi invia a questa pagina del forum...bho!!!

ah no aspetta ci sono riuscito!
grazie mille

E' uscita il primo maggio (negli USA non fanno festa!!) la nuova versione del minirosetta, la 1.18. Peccato che a me dia questo errore: "Project encountered internal error: shared memory".
Cosa caspita significa, a parte il fatto che il loro sito indica 0 wu da scaricare??

Significa che il loro scheduler funziona malino, è un errore lato server. Appena lo risolveranno ti arriveranno le WU

Venturini Dario ha scritto:

Significa che il loro scheduler funziona malino, è un errore lato server. Appena lo risolveranno ti arriveranno le WU

Infatti adesso il feeder segna rosso sul loro sito...

Ieri è stato rilasciato minirosetta 1.19, ho appena scaricato una WU

GHz ha scritto:

Ieri è stato rilasciato minirosetta 1.19, ho appena scaricato una WU

La grafica è ancora penosa
Ma il resume mi sembra migliorato...
Certo che stanno spingendo bene sull'accelleratore

CASP8
Ho visto che è in Sardegna, ma non ho capito come funziona questa competizione. Sono i vari progetti a partecipare??

CASP è una competizione indipendente dal calcolo distribuito.
Ci partecipano vari gruppi di ricerca che hanno sviluppato dei programmi per la predizione delle proteine. Ci sono un tot di proteine da predire (la cui struttura non è ancora stata resa pubblica ed è nota solo ai giudici della competizione) e si vede chi arriva più vicino alla realtà.
E' un modo per vedere a che punto si è arrivati a livello mondiale nella predizione della struttura proteica via software.
Del "giro" del calcolo distribuito ci partecipano sia Rosetta che POEM.

Questo è quanto ne so io. Da adesso dovrebbero già essere distribuite "WUs CASP8", quelle della competizione.
Per la precedente edizione (CASP7) avevo letto che i nomi degli utenti che avevano trovato la miglior struttura erano stati pubblicati (non ricordo dove però).

P.S. Sul forum di Rosetta David Baker ha risposto al mio messaggio sul rosettagame e ha confermato che eventuali buone strutture ripiegate dagli utenti verranno prese in considerazione dai ricercatori per ulteriori studi. Il gioco dovrebbe prendere il via ufficiale tra pochi giorni.

HO appena finito di montare un quad core Q6600 ..... lo giro su Rosetta e vedo come spinge....

Domanda.

Meglio usare Windows xp 32 oppure una distribuzioen Linux (ububtu?) a 64 bit?

Ci sarebbero benfici utilizzando un SO a 64 bit?

Dal David Baker's Journal:

The rosetta game Fold It went live yesterday, and apparently 9000 people had signed up by early afternoon today. it has been very exciting to watch! the competition is getting fierce, and my son is complaining (correctly) that all my suggestions are making his score worse rather than better! we are keeping our fingers crossed about our servers ever since fold it made it onto slash dot yesterday afternoon; so far we have been able to keep running most of the time although there have been some slowdowns.

@canapa: da quanto ha scritto Dario qualche post fa non sembrerebbe che ci siano benefici a usare i 32 bit.

7D9 ha scritto:

Dal David Baker's Journal:

The rosetta game Fold It went live yesterday, and apparently 9000 people had signed up by early afternoon today. it has been very exciting to watch! the competition is getting fierce, and my son is complaining (correctly) that all my suggestions are making his score worse rather than better! we are keeping our fingers crossed about our servers ever since fold it made it onto slash dot yesterday afternoon; so far we have been able to keep running most of the time although there have been some slowdowns.

@canapa: da quanto ha scritto Dario qualche post fa non sembrerebbe che ci siano benefici a usare i 64 bit.

I dettagli dei WU finite sul sito di Rosetta sono cambiati! Adesso ci sono i dati relativi all' RMSD trovato della proteina ed il numero di modelli elaborati. In più c'è anche il grafico.
Non capisco una cosa però: L'RMSD sarebbe il livello di energia? e guardando in quei risultati, se il singolo utente ottiene un RMSD più basso del valore corrispondente di RMSD nella colonna "All users" vuol dire che ha trovato il minimo livello di energia e quindi qualcosa di interessante?

L'RMSD è un indice di quanto la struttura sia vicina a quella trovata sperimentalmente (infatti per proteine "sconosciute" l'RMSD non viene indicato).

In teoria l'RMSD del singolo utente dovrebbe essere al massimo uguale a quello All Users, essendo il singolo utente parte di tutti gli utenti.
Se trovi un RMSD basso vuol dire che hai trovato una buona struttura, ma magari se quella WU viene ancora distribuita un altro troverà una struttura più vicina alla realtà.

Non so se ti o confuso ancora di più le idee...