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valterc Windows 7, Nvidia 980 (25.03.24, 21:11)
valterc https://www.gpugrid.net/results.php?hostid=100638 (25.03.24, 21:11)
puurome2 Purtroppo di Work Unit ATM non ce ne sono più per GPUGRID. Quando c'erano la work unit mi andava sempre in errore. Questo problema delle unità ATM ce l'hanno molti utenti Windows. (24.03.24, 21:09)
samu986 valterc, ah, ok, grazie mille! Speriamo ce ne possano essere allora! (24.03.24, 10:11)
valterc (non sono disponibili sempre però) (22.03.24, 16:18)
valterc uhmmm le workunit ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding vanno anche su Windows (22.03.24, 16:17)
samu986 zioriga, oh...ecco spiegato l'arcano...beh, grazie mille per la delucidazione! Spero che andando avanti ce ne potranno essere anche per Windows. Grazie ancora! (21.03.24, 17:58)
zioriga la risposta è semplice, attualmente le Wu per GPU sono solo per LInux (21.03.24, 11:39)
samu986 Buongiorno a tutti, sapete per caso se GPUGRID funziona bene? A me interessano le WU per GPU, infatti ho selezionato solo quelle, ma non mi arriva niente da mesi. Qualcuno potrebbe aiutarmi, per cortesia? (21.03.24, 10:59)
boboviz problemi su Denis@home (11.03.24, 16:02)
Spot T entity macina con l'armata al completo, io a ranghi ridotti e Boinc.Italy è attualmente prima (in L2) (29.02.24, 19:12)
Spot T Ieri è iniziato FB 2024, con le varie novità e subito lo sprint. Per chi volesse partecipare il progetto è Numberfields (29.02.24, 19:10)
boboviz e con i 5gb da scaricare tutte le volte.... (29.02.24, 15:48)
boboviz con il vecchio wrapper (29.02.24, 15:48)
boboviz ancora le wus virtualbox di Rosetta (29.02.24, 15:48)
zioriga al momento io sono quarto assoluto e BOINC.Italy è al terzo posto (14.02.24, 17:57)
zioriga Per chi volesse 'partecipare, c'è in funzione il challenge BOINCStats su RamanujanMachine https://www.boincstats.com/stats/challenge/team/chat/1121 (14.02.24, 17:57)
Spot T eh... il discorso non fa una piega... (11.02.24, 19:33)
Nubman @valterc: chiedono di te https://www.primegrid.com/forum_thread.php?id=10427&nowrap=true#169137 (11.02.24, 18:29)
BeppeGio Asteroids@home non è chiuso.... ho scaricato un paio di giorni fa (07.02.24, 17:33)
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ARGOMENTO:

[Thread Ufficiale] Rosetta@home 26/03/2020 13:33 #133007

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Grazie delle risp
Si ho controllato e la ram era veramente messa male, ho ridotto tutto a metà ma sta sempre al limite massimo di ram.. vedo come va.
MI sorge un'altra domanda: perché mi arrivano solo wu ciccione da 7-8 ore?? c'è un modo per dare un limite?

13:36: niente come non detto continua a dare errore, provo a reinserire il progetto

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 26/03/2020 13:37 #133009

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Sì, dalle preferenze di progetto.

boinc.bakerlab.org/rosetta/prefs.php?subset=project
COVID-19

Ringraziano per il messaggio: stepas85

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 26/03/2020 15:20 #133010

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26/03/2020 11.50.09 | Rosetta@home | [error] App version has unsupported platform windows_intelx86; changing to windows_x86_64
26/03/2020 11.50.09 | Rosetta@home | [error] State file error: duplicate app version: rosetta windows_x86_64 407
26/03/2020 11.50.09 | Rosetta@home | [error] App version has unsupported platform windows_intelx86; changing to windows_x86_64
26/03/2020 11.50.09 | Rosetta@home | [error] State file error: duplicate app version: minirosetta windows_x86_64 378
26/03/2020 11.50.09 |  | Preferences:
26/03/2020 11.50.09 |  | max memory usage when active: 12239.74 MB

Non uso windows, quindi non so aiutarti, tuttavia il primo messaggio che ho citato sembra indichi la mancanza di qualche libreria a 32bit. Può essere?

Per l'esaurimento della ram, quanta ne puoi dedicare a boinc? Perché dalle impostazioni gli ne assegni circa 12Gb. Dipende da cos'altro fai con il computer.
Ringraziano per il messaggio: stepas85

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 26/03/2020 16:25 #133012

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Ciao
Discorso 32 bit è arabo per me. Ho inserito il file cc_config.xml come mi è stato indicato in modo che non mi arrivino wu 32 bit (se ho capito bene).
Per discorso ram l'ho alzato all'80% ma ho anche folding@home via gpu che me ne mangia 1,5 gb e quindi ho poco spazio di manovra.
Avevo letto che rosetta vuole parecchia ram ma non pensavo cosi tanta.

Grazie a tutti per le indicazioni

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 26/03/2020 17:09 #133013

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Inoltre disabilita nel manager la voce "lascia applicazioni in memoria..." o qualcosa del genere.
Se per qualche motivo , il client sospende una WU e ne comincia un altra ecco che la memoria va in saturazione.

Visto che hai anche F@H (quanto carico hai dedicato ? ) , ti suggerico di mettere i threads al 25% (sono 2 Wu) o al massimo 50% (sono 4 Wu)

Ancora , nel profilo progetto prova a selezionare la durata minima delle WU di 2Ore ,il client dovrebbe tendere a prendere WU più piccole , ma non sempre riesce )

Prova , e facci sapere se cambia qualcosa
Ringraziano per il messaggio: stepas85

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 26/03/2020 20:38 #133015

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Se non risolvi: è meglio chiedere direttamente nel forum di rosetta.

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 09:35 #133021

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Rosetta è questo bellissimo “parco giochi” di programmazione orientato agli oggetti in cui tutto è a portata di puntatore con eleganti funzioni ricorsive per far funzionare tutto e un simulatore Monte-Carlo superveloce per raccogliere nuovi aminoacidi.

Traducendo non avevo fatto molto caso a questo passaggio, ma mi è venuto in mente che questo è il punto di vista di un bioinformatico.
Quando ci buttò un occhio Rjs5, il volontario che aveva lavorato come sviluppatore di grossi progetti presso Intel, l'aveva definito "fluffy code", nel senso che era roba affastellata da anni senza un vero ordine, con parti ridondanti e sbagliate.
I punti di vista....


Sei curioso dei risultati scientifici di Boinc? Guarda la sezione Pubblicazioni.

"We continue to face indifference and resistance from the high­-performance computing establishment." D. Anderson


The first italian guy with 1 milion (and half) on Ralph

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 12:10 #133025

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Chissà quante risorse stiamo sprecando. :rolleyes:
COVID-19

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 12:16 #133026

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Ti faccio un esempio :

E' come prendere l'intero kernel linux , e riscriverlo interamente in un altro linguaggio

Un esempio è Wayland , riscritto da zero , futuro sostituto di Xorg ... da quanti anni ci stanno dietro ? E non è nemmeno completo
Xorg ha un sacco di righe di codice , anche vecchio , ma funziona.

E' facile dire "bisogna riscrivere da zero" . Riscrivere da "zero" vuol dire commettere anche errori , fix e quan'taltro con conseguente allungamenti dei tempi

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 15:12 #133029

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Inoltre disabilita nel manager la voce "lascia applicazioni in memoria..." o qualcosa del genere.
Se per qualche motivo , il client sospende una WU e ne comincia un altra ecco che la memoria va in saturazione.

Visto che hai anche F@H (quanto carico hai dedicato ? ) , ti suggerico di mettere i threads al 25% (sono 2 Wu) o al massimo 50% (sono 4 Wu)

Ancora , nel profilo progetto prova a selezionare la durata minima delle WU di 2Ore ,il client dovrebbe tendere a prendere WU più piccole , ma non sempre riesce )

Prova , e facci sapere se cambia qualcosa


allora ho provato varie cose:
1° - "lascia applicazioni in memoria..." > non ha funzionato sempre in errore andava
2° - F@H lo faccio andare solo di GPU, 0 di CPU
3° - WU da 2 ore > questo l'avevo già impostato ma ieri sera continuava a mandarmi wu da 6-7 ore

Alla fine cosa ho fatto: chiuso F@H e sono ripartito con Rosetta con wu da 1-2 ore, quando vedevo che non mi dava più problemi ho aumentato via via i thread e adesso sono a 12 su 16 senza grossi problemi. Oggi per capire se era F@H a darmi problemi l'ho fatto ripartire e fino ad adesso 0 wu in errore.

A questo punto sono propenso a pensare che era si un problema di ram ma sopratutto che le wu da 7-8 ore hanno bisogno di una svagonata di ram.

Con l'occasione vi chiedo una curiosità: come mai nelle stats di questo sito Rosetta non viene aggiornata? io ad esempio non risulto neanche nel team

Grazie ancora
Ciao

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 15:14 #133030

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Hola massima potenza con 3pc Ryzen7 e 4 Gpu su Rosetta e Gpugrid
Non è che per caso avete un file cc_config per configurare meglio la ram su Rosetta per Win10
Grazie

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 15:55 #133031

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Anche il mio ryzen ha 13 core su 16 su Rosetta.
Ma anche GpuGrid lavora su Covid19???

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 16:08 #133032

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Diciamo che pure Gpugrid lavora sulle proteine quindi aiuta a trovare una cura pure su questo progetto se ho capito bene.
Io uso max 8core su R7 è più veloce se lasci liberi i core virtuali questo su tutti i progetti è sempre un mio accorgimento

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 16:21 #133034

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Io uso max 8core su R7 è più veloce se lasci liberi i core virtuali questo su tutti i progetti è sempre un mio accorgimento


Adesso con 13 core, ogni WU dura mediamente 7/8 ore.
Impostando la cpu al 50%, i tempi dovrebbero abbassarsi notevolmente. Se fosse proporzionale, dovrebbero impegare non più di 5 ore ciascuna.
Provo....

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 16:24 #133035

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Con l'occasione vi chiedo una curiosità: come mai nelle stats di questo sito Rosetta non viene aggiornata? io ad esempio non risulto neanche nel team

Grazie ancora
Ciao


Ci sono problemi di aggiornamento interno con molte statistiche di progetti.
Vi invitiamo a fare affidamento al momento a BOINC.Stats o alternativi.

Cercheremo di risolvere ma non sono in grado di dare tempistiche.
Ringraziano per il messaggio: stepas85, ReLeon

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 18:46 #133039

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@zafar
Che mi risulti, rosetta@home non rispetta le impostazioni del cc_config.xml. Quindi al momento non mi sembra ci sia un modo per ottimizzare l'uso della memoria.

@zafar @Leonardo [Toscana]
Occhio che le WU di rosetta non sono come quelle degli altri progetti.
La durata delle WU la decidete voi attraverso le impostazioni che trovate nel vs. account.
Quindi ridurre il numero di core/thread non le fa terminare prima. Probabilmente vi verranno assegnati più crediti per ogni WU.
Ma dal punto di vista del RAC, conviene usare più core/thread possibili.

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 20:43 #133046

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@zafar @Leonardo [Toscana]
Occhio che le WU di rosetta non sono come quelle degli altri progetti.
La durata delle WU la decidete voi attraverso le impostazioni che trovate nel vs. account.
Quindi ridurre il numero di core/thread non le fa terminare prima. Probabilmente vi verranno assegnati più crediti per ogni WU.
Ma dal punto di vista del RAC, conviene usare più core/thread possibili.


Infatti le nuove WU, elaborate con meno core, le ho al 50% e sono passate 4 ore. Quindi il tempo è comunque quello.
A livello di risultati (intendo quelli utili per la ricerca, non mi interessano più o meno crediti) è meglio elaborare più WU contemporaneamente oppure fornire più risultati su poche WU?

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 20:50 #133047

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Penso siano più interessati ad elaborare più WU possibile.

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 20:56 #133048

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Ricevuto!
Riportato l'uso della cpu all'85%

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/03/2020 21:22 #133049

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Chissà quante risorse stiamo sprecando. :rolleyes:

In realtà non è sprecato.
Dal punto di vista bioinformatico il codice funziona, visti i molti ed importanti risultati raggiunti negli anni.
Devi anche considerare che:
1 - Il codice è nato più di 15 anni fa in Fortran.
2 - Poi è stato convertito in C++ (portandosi dietro tutta una serie di problemi).
3 - Ci lavorano molte persone, con diversi stili di codifica.
4 - Sono circa 3 milioni di righe di codice, non è proprio una passeggiata ottimizzare il tutto.

Ecco perchè dal punto di vista della "pura" programmazione, è stilisticamente un accrocchio.
Un accrocchio, che, ripeto, funziona!!!
Ovvio che tutti, a partire dal sottoscritto, vorremmo applicativi ottimizzati (con SSE o Avx) o client gpu, ma per ora ci dobbiamo accontentare.


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