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Leonardo [Toscana]
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Buonasera, da ormai diverso tempo non sto ricevendo wu da Rosetta.
Siccome non seguo il loro forum (avvio il pc coi miei progetti e spesso non guardo neanche se vanno o meno), mi sapete dire se sono loro ad aver problemi oppure se i problemi sono nel mio pc?
Ho provato a reinstallare Boinc (VirtualBox incluso), a fare il reset del progetto, ad uscire e rientrare, ma il registro eventi continua a segnalare "Scheduler request completed: got 0 new tasks"...
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boboviz
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Ho provato a reinstallare Boinc (VirtualBox incluso), a fare il reset del progetto, ad uscire e rientrare, ma il registro eventi continua a segnalare "Scheduler request completed: got 0 new tasks"...
Hai controllato nel tuo profilo utente sul sito se le wus virtualbox sono abilitate per il pc??
Sei curioso dei risultati scientifici di Boinc? Guarda la sezione Pubblicazioni.
"We continue to face indifference and resistance from the high-performance computing establishment." D. Anderson
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boboviz
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Dopo secoli, ci sono
novità scientifiche
dal progetto
The IPD is excited to announce it's first designed protein medicine with full approval abroad.
Congrats and thank you to all Rosetta@home contributors! The computing you have provided has greatly aided in de novo protein design challenges such as vaccine development leading to breakthroughs like this.
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boboviz
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Sul forum di Rosetta i volontari stanno testando il nuovo wrapper di Boinc (che se aspettano gli amministratori del progetto, campa cavallo).
Quasi quasi, se funziona, ci faccio una guida all'uopo.
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Nubman
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Ciao, è normale che il fondatore del team su Rosetta non sia più TeamAdmin, ma un certo Marco Chiarini, membro dal 2 maggio 2020?
boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=276
Credo che qualcuno abbia avviato la richiesta di cambio del fondatore del team e abbia avuto successo.
Se ne siete al corrente ed è del tutto normale, passate avanti.
Ringraziano per il messaggio: boboviz
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CryptoBlinx
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Buonasera,
ho dei problemi con l'esecuzione delle task di python.
Ho scaricato circa una decina di task di rosetta python e tutte mi danno "errore di calcolo".
Ho BOINC e VirtualBox aggiornati, la virtualizzazione è abilitata e ho provato a resettare il progetto ma nulla è cambiato.
Nei log non c’è niente a parte il “task finished”.
Qualcuno ha avuto questo tipo di problema?
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Ultima Modifica: da CryptoBlinx.
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boboviz
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Buonasera,
ho dei problemi con l'esecuzione delle task di python.
Ho scaricato circa una decina di task di rosetta python e tutte mi danno "errore di calcolo".
Ho BOINC e VirtualBox aggiornati, la virtualizzazione è abilitata e ho provato a resettare il progetto ma nulla è cambiato.
Nei log non c’è niente a parte il “task finished”.
Qualcuno ha avuto questo tipo di problema?
I log di Boinc ti indicano che sia presente la Virtualbox?
All'avvio deve esserci una riga di questo tipo 31/08/2022 08:37:35 | | VirtualBox version: 6.1.32 Hai controllato la quantità di ram? Le wus di phyton sono ghiotte di memoria....
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Ringraziano per il messaggio: CryptoBlinx
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CryptoBlinx
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31/08/2022 09:55:51 | | VirtualBox version: 6.1.36 Per quanto riguarda la RAM ho disponibili 10,5 Gb dopo l'avvio di Windows, bastano?
Nelle preferenze di elaborazione ho controllato la quantità di RAM disponibile che risulta essere 14 Gb in idle.
Le ultime task ricevute ho provato ad eseguirle una alla volta, sospendendo tutte le altre attività e senza altri processi in background, ma continua a dare errore.
Da quello che ho capito (spero di non sbagliarmi) le task di python vengono eseguite su Linux, non è che su VirtualBox devo creare una macchina virtuale Linux?
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boboviz
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Da quello che ho capito (spero di non sbagliarmi) le task di python vengono eseguite su Linux, non è che su VirtualBox devo creare una macchina virtuale Linux?
Quando scarichi la prima volta, hai scaricato anche l'hd virtuale di una macchina linux che si avvia in automatico (attraverso il wrapper Vbox) quando parte la wu
A questo punto occorrerebbe vedere i log sul sito di Rosetta e magari aprire lì un thread.
Le tue macchine sono visibili?
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boboviz
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Credo che qualcuno abbia avviato la richiesta di cambio del fondatore del team e abbia avuto successo.
Se ne siete al corrente ed è del tutto normale, passate avanti.
CI stiamo lavorando.
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Ringraziano per il messaggio: Nubman
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Nubman
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@CryptoBlinx: hard disk virtuale.
Comunque, partiamo dal log di una tua workunit Python andata in errore.
boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=1494166678<core_client_version>7.20.2</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
Incorrect function.
(0x1) - exit code 1 (0x1)</message>
<stderr_txt>
2022-08-30 18:29:32 (7836): Detected: vboxwrapper 26202
2022-08-30 18:29:32 (7836): Detected: BOINC client v7.20.2
2022-08-30 18:29:40 (7836): Error in guest additions for VM: -2147024891
Command:
VBoxManage -q list systemproperties
Output:
VBoxManage.exe: error: Failed to create the VirtualBox object!
VBoxManage.exe: error: The object is not ready
VBoxManage.exe: error: Details: code E_ACCESSDENIED (0x80070005), component VirtualBoxClientWrap, interface IVirtualBoxClient
2022-08-30 18:29:40 (7836): Detected: VirtualBox VboxManage Interface (Version: 6.1.36)
2022-08-30 18:29:47 (7836): Error in host info for VM: -2147024891
Command:
VBoxManage -q list hostinfo
Output:
VBoxManage.exe: error: Failed to create the VirtualBox object!
VBoxManage.exe: error: The object is not ready
VBoxManage.exe: error: Details: code E_ACCESSDENIED (0x80070005), component VirtualBoxClientWrap, interface IVirtualBoxClient
2022-08-30 18:29:47 (7836): WARNING: Communication with VM Hypervisor failed.
2022-08-30 18:29:47 (7836): ERROR: VBoxManage list hostinfo failed
18:29:47 (7836): called boinc_finish(1)
</stderr_txt>
]]> Ci sono vari errori su cui lavorare.
Strano anche l'errore che hai avuto su una wu dell'app Rosetta, che neanche usa Virtualbox.
boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=1494116107<core_client_version>7.20.2</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
The extended attributes are inconsistent.
(0xff) - exit code 255 (0xff)</message>
<stderr_txt>
command: projects/boinc.bakerlab.org_rosetta/rosetta_4.20_windows_x86_64.exe @rb_08_27_400427_395554_ab_t000__h002_robetta_FLAGS -in::file::fasta t000__h002.fasta -in:file:boinc_wu_zip rb_08_27_400427_395554_ab_t000__h002_robetta.zip -frag3 rb_08_27_400427_395554_ab_t000__h002_robetta.200.3mers.index.gz -fragA rb_08_27_400427_395554_ab_t000__h002_robetta.200.14mers.index.gz -fragB rb_08_27_400427_395554_ab_t000__h002_robetta.200.5mers.index.gz -nstruct 10000 -cpu_run_time 28800 -boinc:max_nstruct 20000 -checkpoint_interval 120 -mute all -database minirosetta_database -in::file::zip minirosetta_database.zip -boinc::watchdog -boinc::cpu_run_timeout 36000 -run::rng mt19937 -constant_seed -jran 1869018
Using database: database_357d5d93529_n_methyl\minirosetta_database
</stderr_txt>
]]> Questo sembra essere un errore legato a Windows: www.google.com/searc...nded+attributes+are+inconsistent+windows
Ammetto di non sapere che pesci pigliare.
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CryptoBlinx
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@boboviz @Nubman Thanks for the help 
Ho trovato il problema: nel wizard di boinc avevo fleggato l’opzione “service install”, così avevo installato boinc come un programma “daemon” e non aveva sufficienti privilegi per comunicare con Virtual Box.
Dopo averlo reinstallato senza l’opzione “service install”, finalmente le task di python funzionano.
Ringraziano per il messaggio: boboviz, Nubman
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Leonardo [Toscana]
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Buongiorno, stamani all'avvio del pc mi è uscito il seguente avviso:
E i file interessati sarebbero i seguenti:
Mi devo preoccupare? O si tratterà di un falso allarme? Perchè l'antivirus Bitdefender non mi ha rilevato niente...
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boboviz
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E' il classico falso positivo.
Se vuoi puoi farlo presente nel forum del progetto (anche se non so possa servire a qualcosa)
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boboviz
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Uno degli amministratori del progetto, dopo secoli, si è fatto vivo sul forum e ha detto che l'attuale batch sarà di circa 5 milioni di wus....
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boboviz
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Mi ero perso, a fine settembre, questo messaggio di Kim sul forum sui futuri lavori riguardanti Rosetta@Home
There are plans for more python tasks, but we are still working on creating the new disk image for the VM.
This image will likely be larger in size since we hope to run some of the latest deep-learning based methods for protein design and validation.
Computing resources are still very much in high demand within the Baker Lab and IPD so Rosetta@home will definitely help once we can get the latest software set up and running.
Also, the standard rosetta application is currently being worked on for an update.
The IPD has hired a software developer specifically to help expedite this.
I am not sure about timelines at the moment but hopefully there should be updates to both projects/apps within the next month or so.
Sembra stiano lavorando ad un nuovo applicativo VirtualBox (speriamo usando il nuovo wrapper ufficiale)
Inoltre dovrebbero rilasciare, dopo oltre 2 anni, un applicativo standard aggiornato e che ci sia uno sviluppatore apposito per questo lavoro.
Vediamo cosa vien su....
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Ultima Modifica: da boboviz.
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