BOINC.Italy
La community italiana dedicata al calcolo distribuito
Duncan Penfold-Brown, un ricercatore associato del progetto Human Proteome Folding, offre un tour e la dimostrazione di due interfacce web che organizzano i risultati dei calcoli del Human Proteome Folding per fare in modo che quei risultati siano accessibili ai ricercatori e al pubblico.
Finora, disponiamo di 18 nuovi composti da testare in vitro e in vivo. I risultati dei test saranno messi a disposizione non appena saranno stati completati.
Abbiamo altri 23 potenziali target in corso di valutazione per il test.
Grazie per la vostra partecipazione.
Cari rosicchiatori di DSFL,
proprio oggi abbiamo aggiornato lo stato del progetto DSFL. Potete vederlo visitando la sezione news del sito: http://pecet-colombia.org/worldcommunitygrid/drugsearch/
Aggiornamento del Progetto FightAIDS @ Home - Volume 11
Un documento riguardante il database ProteinWorldDB, creato con i risultati del progetto Genome Comparison, è stato pubblicato negli Atti del 7 ° Convegno brasiliano sulla Bioinformatica, BSB 2012, Campo Grande, Brasile, 15-17 agosto 2012.
I ricercatori hanno scoperto come creare alcune nuove classi di proteine e Rosetta@Home è stata assolutamente fondamentale in questo lavoro: quando viene progettata una nuova struttura, l'ultima cosa (prima di ordinare un gene sintetico così da poter creare una proteina in laboratorio) che fanno è quella di inviarla ai volontari per predire la struttura - se si "piega" come hanno progettato, vanno avanti con essa, ma se scoprono che lo stato di energia più basso è una struttura diversa, tornano al tavolo di progettazione.
Gli amministratori di Milkyway@home hanno creato un canale Youtube per le visualizzazioni.
I dettagli sono qui: http://milkyway.cs.rpi.edu/milkyway/forum_thread.php?id=3219 .
Valutazione attuale: 5 / 5
Fuffari e non
Lo so, i miei post in questo blog cominciano ad essere numerosi ma spero di non annoiare nessuno di quelli che li leggono (al massimo, chiudete il browser e uscite a bervi una birra). Rileggendo i primi due articoli (e anche in seguito alla interessante discussione con il buon Hellcobra sull’”affaire Vannoni”) mi sono reso conto di aver parlato di casi singoli (omeopatia e il dottor S.), lasciando in secondo piano il metodo scientifico, i suoi pregi, i suoi difetti e chi (da qui in poi li chiamerò “i fuffari”) ritiene che il metodo scientifico non serva a nulla. Per fare questo dovrò, ahivoi, parlare anche di alcuni concetti come bias, doppio cieco, ecc, ma non preoccupatevi, cercherò, per quanto nelle mie possibilità di essere chiaro.
Greg, amministratore del progetto, annuncia che la post-elaborazione di 2,1049+, la loro quarta elaborazione pesante, è in corso e si aspettano che impiegherà circa 4 settimane.Le fattorizzazioni di F1229 e L1797 sono state completate. Stanno ora lavorando sulla successiva difficile fattorizzazione GNFS ed il setaccio del loro primo, 3,745+, è in corso.
Gianni de Fabritiis, amministratore del progetto, annuncia che dato che tutti si sono già spostati alle applicazioni cuda4.2, hanno deprecato la cuda3.1 dalla coda corta
La versione è stata aggiornata alla release 3.46 per includere i recenti sviluppi nella densità degli elettroni e in altre misurazioni. Questo update risolve inoltre un bug nei calcoli del gradiente di densità che ha, in alcuni casi, causato il crash dell'applicazione nelle simulazioni lunghe. Se ci sono problemi, vi invitiamo a postarli sul forum.
Il personale del NEES @ UCSB (Network for Earthquake Engineering Simulation presso University of California, Santa Barbara) ha ospitato un open house per futuri insegnanti di scienze nella Givertz Graduate School of Education all'Università di Santa Barbara nel mese di aprile 2013. Sandra Seale e Francesco Civilini, specialisti del progetto NEES, hanno tenuto un corso di formazione in "Crea il Tuo Terremoto" utilizzando il sensore QCN. Gli insegnanti hanno scaricato il software QCN e fatto esercitazioni pratiche creando i propri terremoti e stampando i loro grafici.
David Anderson, amministratore del progetto BOINC, annuncia che l'applicazione AMD Showcase elenca due progetti basati su BOINC, Poem@home ed Einstein@home, con le applicazioni che utilizzano le GPU AMD.
I ricercatori hanno annunciato, il primo Aprile, che secondo le loro statistiche, mancano 25 giorni alla fine del progetto. L'accellerazione impressa dalle GPU ha permesso di ridurre di molto i tempi previsti e sperano che questa esperienza possa venir replicata anche su altri progetti WCG.
Nell'attuale esperimento, 5 nuove paia di diagonali ortogonali di quadrati latini di ordine 10 sono state trovate da:
Finalmente è disponibile anche l'applicazione per il progetto SETI@Home! Questa versione supporta i processori ARMv6 con FPU e i processori ARMv7. Buona elaborazione!
Di seguito riporto una comunicazione di Duncan che chiede l'invio di video prodotti dagli utenti QCN che potrebbero essere ritrasmessi dalla TV britannica. Pubblicità per il progetto.
Cari tutti,
Stiamo lavorando su un pezzo per la televisione britannica per un programma scientifico chiamato "Dara O'Briain Science Club" che andrà in onda nel Regno Unito dove ha molti milioni di spettatori e molti altri nel resto del mondo. Stiamo lavorando con il responsabile del progetto, Elizabeth Cochran, per fare un breve inserto per uno spettacolo di divulgazione scientifica in prima serata per presentare il progetto QCN. Elizabeth mi ha gentilmente dato il permesso di contattare la comunità QCN attraverso questo forum. Stiamo cercando di spiegare l'attuale successo della rete - mostrando come questa sia davvero solo all'inizio ma già prendono parte persone provenienti da tutto il mondo.
Siamo alla ricerca di filmati autoprodotti dai partecipanti che raccontino il motivo per cui partecipano alla rete QCN e che cosa questa significa per loro. Potete coinvolgere vostra moglie o vostro marito, i vostri figli - chiunque può partecipare! Il filmato potrebbe essere girato con un iPhone, webcam o simili - la qualità non è importante. Speriamo che siate in grado di caricare il video su un canale privato di YouTube usando Dropbox - un servizio gratuito di upload:
https://www.dropbox.com/home
Idealmente quello che stiamo cercando è:
• Il tuo nome di battesimo - e perché ha aderito alla rete QCN - (circa 30 secondi)
• Quali sono le tue speranze per la rete? - (20 secondi circa)
• gesto in camera con il nome su carta o simile (qui licenza per essere creativi!) - (Circa 20 secondi).
Vi prego di contattarmi direttamente su Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo. se avete domande e di inviare video brevi. Il nostro obiettivo è fare un montaggio con i filmati da utilizzare nel programma - per mostrare la portata e il successo della rete.
Grazie per il vostro aiuto!
Duncan
Il progetto è da considerarsi sostanzialmente terminato.
Quando avremo verificato tutti i risultati fin qui ricevuti, troveremo verosimilmente alcune WU incomplete che però completeremo in locale sul nostro cluster. Questo perchè le WU in questione erano più lunghe di quelle standard e quindi creavano problemi ad alcuni utenti in rete.
Faremo poi un ulteriore controllo per verificare di non aver perso per strada qualcosa, qualche risultato, e poi dichiareremo questo progetto concluso. I ricercatori analizzeranno quindi i dati e pubblicheranno i risultati ottenuti. Grazie a tutti gli utenti per il loro contributo a questo progetto e alla WCG in generale.
Hanno iniziato nuove elaborazioni oggi.
Teemu Mannermaa, amministratore del progetto, annuncia che sembra che siano rimasti senza lavoro da spedire ieri per la seconda volta questa settimana (l'altro incidente è accaduto 4 giorni fa) ed entrambi sono accaduti perché il keymaster di distributed.net non ha spedito nessun lavoro per generare nuove workunit.
Matt Lebofsky, amministratore del progetto, annuncia che sposteranno molti dei loro server in una collocazione con un miglior raffreddamento, potenza e rete che dovrebbe migliorare i tempi di attività in generale. Questa procedura inizierà lunedì 1 Aprile alle 8:00 (PDT) e dovrebbe durare 3 giorni durante i quali l'intero progetto non sarà disponibile.
Bearnol, amministratore del progetto, annuncia che un fattore di 12 cifre di P2203 è stato scoperto dal progetto 36768 volte
Dopo alcuni problemi tecnici negli ultimi giorni, ora sono pronti per spedire il primo studio di Tune Scan for the Dynamic Aperture che stanno eseguendo al CERN.
Rilasciata la nuova versione 0.4.3.2: ora gestisce i certificati SSL per gli accessi HTTPS, è stato corretto il comportamento in caso di liste di file di distribuzione corrotte e il supporto di installazione su SDCard.
E' stata inoltre rimossa l'applicazione di sieving Cullen/Woodall del progetto PrimeGrid perchè obsoleta.
Bruce Allen, direttore di Einstein@home, annuncia che due articoli che descrivono la ricerca delle radio pulsar di Einstein@home ed alcune altre scoperte, sono stati recentemente spediti per la revisione.
Eric Korpela, amministratore del progetto, annuncia che l'applicazione SETI@home 7.00 è stata rilasciata per le schede video. La maggior parte dei cambiamenti sono piccoli oltre ad essere diventata una versione per CUDA 5.0.
I ricercatori di Rosetta hanno imparato come progettare una nuova classe di proteine che possono essere usate sia come medicinali che come sensori. Queste proteine sono piccole molecole con meno di 50 atomi. Ci sono molti medicinali, come gli anticoaugulanti, che possono essere molto pericolosi se assunti in grandi dosaggi. Hanno avuto successo nel progettare proteine che si uniscono a specifiche molecole in maniera molto stretta; queste proteine possono essere usate come antidoti in caso di overdose - per esempio è stata progettata una proteina che può controllare la tossicità causata dall'overdose del farmaco "digoxin" utilizzato per problemi cardiaci. Con i collaboratori stanno lavorando per utilizzare queste proteine per identificare i livelli delle molecole bersaglio nel sangue o nell'ambiente in cui si sviluppano
Grazie a Radim (Kyong) Vančo, Asteroids@Home supporta anche BOINC su sistemi Android! L'applicazione è disponibile sul server del progetto e si scarica automaticamente dal BOINC Manager (se selezionata).
Maggiori informazioni sull'applicazione specifica sul sito del progetto.
C'è una nuova applicazione per i device ARM che girano su Android
L'applicazione Cruncher è ora disponibile per ARM su Linux. Ora potete elaborare sul Raspberry Pi ed altri sistemi ARM.
Jake Weiss, scienzato del progetto, annuncia che oggi hanno iniziato nuove elaborazioni.
Gianni de Fabriitis, amministratore del progetto, annuncia che hanno controllato le statistiche di errore e hanno visto che sono più alte del normale così invitano ad abortirle. Nel loro laboratorio lavorano perfettamente così non hanno ben chiaro il problema. Hanno bisogno di eseguirne alcune in beta per cercare di capire il problema.
Ben Segal, amministratore del progetto, raccomanda ai volontari di aggiornare all'ultima versione di VirtualBox (4.2.8). (Il bug che era stato introdotto nella 4.2.6 ed affliggeva i beta tester che utilizzavano il nuovo wrapper, è stato risolto nella 4.2.8).
Una collaboratrice del progetto, Debi Kilb, ha tenuto una conferenza TEDx sull' "Utilizzo di Videogiochi per coltivare futuri scienziati" che include un videogioco creato attorno al progetto QCN.
Potete guardare il video del suo discorso su youtube:
Greg, amministratore del progetto, annuncia che il numero di Fibonacci F1797 è stato fattorizzato. Questo è il prodotto di numeri primi di 112 e 136 cifre.
Il team di CPDN ha ricevuto un finanziamento per un progetto di tre anni per implementare un nuovo modello climatico regionale con Weather At Home per studiare la misura che il cambiamento climatico ha sull'ampiezza e la frequenza degli eventi climatici estremi in Africa, come, ad esempio, l'impatto sul flusso dei fiumi e delle colture.
L'applicazione del progetto WUProp@Home è stata aggiornata alla versione 3.42.
Greg, amministratore del progetto, annuncia che 5233,71- è stato fattorizzato. È il prodotto di numeri primi di 93 e 169 cifre.
MJH, amministratore del progetto, annuncia che a partire da questo aggiornamento dell'applicazione ACEMD Long, non supporteranno più le GPU con capacità elaborativa 1.2 o minore. In pratica, tutte quelle sotto le specifiche della GTX260. (serie 8000, 9000 e schede inferiori a 2x0, 3x0).
Ben Segal, amministratore del progetto, annuncia che i server del CERN sono stati riavviati con successo e tutte le macchine virtuali dovrebbero riprendere ad elaborare automaticamente. Nessun intervento da parte dell'utente è necessario.
Disponibile la nuova versione 0.4.3 in cui sono stati risolti un paio di problemi di crash dell'applicazione (all'avvio e nel caso di prolungate attività di BOINC). Piccoli cambiamenti anche ai valori di default delle preferenze locali.
Ora è disponibile anche la versione tradotta in italiano (ndr: provatela e riportate eventuali correzioni sul forum di BOINC.Italy, raccoglieremo i suggerimenti e invieremo al responsabile del progetto i nuovi file di testo finali).
Ben Segal, amministratore del progetto, annuncia che da sabato notte hanno avuto dei problemi con i server centrali del CERN che possono impedire alle macchine virtuali di T4T di ottenere e restituire i lavori.
Questi problemi sono stati causati da interventi sulla linea di alimentazione del CERN durante il weekend!
Il progetto Harmonious Tree terminerà presto. Se volete ottenere alcuni badge per questo progetto, vi sono rimasti solo alcuni giorni, forse settimane; nessuna nuova workunit sarà inserita. Se avete un Raspberry Pi, potete elaborare Harmonious Tree anche sul Pi. Qui potete vedere quante workunit sono rimaste.
Dopo aver testato la nuova applicazione, è giunto il momento di lanciare un nuovo progetto. I ricercatori hanno creato 6000 WU nella coda lunga. Ogni WU darà all`incirca 100'000 crediti. I ricercatori chiedono di segnalare eventuali problemi dal momento che le nuove WU includono delle nuove funzinalità.
Greg, amministratore del progetto, annuncia che hanno aggiornato il software del server BOINC all'ultima versione. Mettetelo a conoscenza se incontrate dei problemi
Stanno testando un'applicazione Raspberry Pi per il progetto Harmonious Tree. Per questo stanno cercando dei tester che hanno Linux sul loro RaspPi e che possano collegare BOINC sul progetto yoyo@home e riportare, sul loro forum, come lavora l'applicazione.
Vadimas Starikovicius, amministratore del progetto, annuncia che finalmente hanno iniziato la soluzione di un nuovo problema. È il progetto scientifico più accademico in questo momento e gli è servito un po' di tempo per coinvolgere i loro studenti. Eventualmente, due dei loro studenti del programma Technomathematics (lt) ( Stasys Biekša e Aivaras Sukackas) hanno interesse nel creare la grafica della loro attuale applicazione "DES key searching".
Kevin, amministratore del progetto, annuncia che sono tornati e hanno messo 2924 galassie nella coda da elaborare
Matt Lebofsky, amministratore del progetto, annuncia che l'intero laboratorio era stato spento durante questo weekend per delle riparazioni elettriche. Sono tornati online domenica mattina (24 febbraio)
David Anderson, amministratore del progetto BOINC, annuncia un add-on per Linux/KDE che permette di monitorare le attività di BOINC direttamente dal vostro dekstop: BOINC Monitor.
